邪恶组织哈梅尔达每晚都会在城市诱拐女性。一个少女站了出来对抗他们，那就是魔法斗姬芙罗缇亚。某天，她救下了一位有着魔法斗姬潜力的少女，她们的命运都将因此而改变……
1457年的清泠浦，一场注定失败的守护，一段永被铭记的情谊。
2024年，一名少女意外穿越回 2003年，而她的姐姐将在几天后被一名蒙面杀手杀害。她能否在不毁掉未来的情况下改变过去?
摄影师工藤太郎在坐飞机的途中发现一架太空囊坠入大海，那正是4个月前离奇失踪的无人木星探测器赫利俄斯7号。回国后的工藤接到陪同开发公司调查队前往塞吉欧岛的工作，而塞吉欧岛正位于赫利俄斯7号坠落地点的附近…… 另一方面，塞吉欧岛突然出现巨大的怪兽，这一切似乎和赫利俄斯7号有关……